גדר ההפרדה המהווה גבול בטחוני החוצץ בין התושבים הפלסטינים ביהודה ושומרון לבין מרכזי אוכלוסייה ישראליים החלה בבנייתה בשנת 2002. קבלת ההחלטה בממשלת ישראל על בניית הגדר התקבלה באפריל 2002, בעקבות גל פיגועי ההתאבדות בחודש מארס 2002 אשר כלל 135 הרוגים.

סקירת ספרות לעבודת סמינריון אקדמית הבוחנת את תדמית ישראל כמדינה דמוקרטית בעקבות הקמת גדר הביטחון בירושלים.

בשל היותה גבול בטחוני מצוידת גדר ההפרדה באמצעי חישה אלקטרוניים, באמצעי תצפית ובכלי נשק להפעלה מרחוק . כמו כן חלק מהתוואי של הגדר כולל חומת בטון גבוהה בתוך השכונות הפלסטיניות של ירושלים , מערב קלקיליה וטול כרם. מטרתה הרשמית לשמה נבנית גדר ההפרדה היא מניעת כניסתם של מחבלים ומפגעים לשטחה של מדינת ישראל.

גדר ההפרדה נמצאת כיום בשלבי בנייה אם כי התוואי הסופי של איננו ברור וזאת מאחר וקיימים מחלוקות  פוליטיות  בציבור הישראלי, קיים לחץ בינלאומי על ישראל וכן הצד הערבי דורש כי הגדר תמוקם על הקו הירוק ולא תעבור דרך השטחים.

גדר ההפרדה ,עוברת בתוך ישובים פלסטיניים כאשר כל יציאה מישובים אלו מחייבת אישור מהשלטון הישראלי וכן נוצר מצב בו התושבים מופרדים ממקורות פרנסתם , מבית חולים ומבתי הספר שלהם. תושבים פלסטינים  רבים עתרו לבג"ץ עקב  בעיות אלו  והצליחו לעכב את בנייתה של הגדר.

העיר ירושלים, בירתה של מדינת ישראל, היוותה מאז ראשית העימות יעד מועדף לביצוע פיגועים. בעיר עצמה בוצעו במהלך העימות 580 פיגועים. העיר היא עיר מעורבת, בה אוכלוסיות גדולות – יהודית וערבית – מתגוררת בסמוך זו לזו, והיא ממוקמת בסמוך מאוד לערים (בית לחם ורמאללה) ולכפרים פלסטיניים העוטפים אותה מכל עבריה ואשר תושביהם מקיימים קשר הדוק עם תושבי ירושלים.

הקמת "גדר ביטחון" גם באזור ירושלים הייתה מחויבת המציאות, הן במטרה להגן על תושבי ירושלים עצמה והן במטרה למנוע מארגוני הטרור לנצל פרצה זו כדי להחדיר מחבלים מתאבדים לביצוע פיגועים באזורים אחרים בתוככי ישראל.